В целях совершенствования механизма возврата превышения налога на добавленную стоимость из бюджета ПРИКАЗЫВАЮ:

1. Внести в приказ Министра финансов Республики Казахстан от 29 июля 2010 года № 385 «Об утверждении Инструкции по применению Системы управления рисками в целях возврата превышения налога на добавленную стоимость» (зарегистрированный в Реестре государственной регистрации нормативных правовых актов Республики Казахстан 16 августа 2010 года под № 6398, опубликованный в газете «Казахстанская правда» от 7 сентября 2010 года № 234 (26295)) следующие изменения и дополнения:
в Инструкции по применению Системы управления рисками в целях возврата превышения налога на добавленную стоимость (далее - Инструкция), утвержденной указанным приказом:
пункты 11 и 12 изложить в следующей редакции:
«11. В случае выявления по результатам аналитического отчета у поставщиков товаров, работ, услуг нарушений налогового законодательства, возврат суммы превышения НДС производится в пределах предъявленных сумм, уменьшенных на суммы превышения НДС, не подлежащие возврату в связи с установлением у поставщиков товаров, работ, услуг нарушений налогового законодательства.
При этом сумма превышения НДС, подлежащая возврату, определяется в следующем порядке:
1) устанавливается наименьшая из сумм НДС, отнесенных в зачет поставщиками товаров, работ, услуг начиная от каждого налогоплательщика, по которому установлены нарушения налогового законодательства, до плательщика НДС, представившего требование (налоговое заявление) о возврате превышения НДС;
2) устанавливается наименьшая из следующих сумм:
суммы НДС, суммарно сложившейся из сумм НДС, определенных в соответствии с подпунктом 1) настоящего пункта
и
суммы НДС, отнесенной в зачет плательщиком НДС, представившим требование (налоговое заявление) о возврате превышения НДС, от непосредственного поставщика;
3) из предъявленной к возврату суммы превышения НДС вычитаются суммы НДС, определенные в порядке, указанном в подпункте 2) настоящего пункта.
Примеры определения суммы превышения НДС, подлежащей возврату, приведены в приложениях 5 и 6 к настоящей Инструкции.»;
«12. Возврат оставшейся суммы превышения НДС, за исключением случаев, указанных в пункте 10 статьи 635 Налогового кодекса и пункте 11 статьи 25 Закона Республики Казахстан от 10 декабря 2008 года «О введении в действие Кодекса Республики Казахстан «О налогах и других обязательных платежах в бюджет» (Налоговый кодекс), производится по мере устранения поставщиками товаров, работ, услуг нарушений налогового законодательства путем включения налогоплательщиком данной суммы в требование о возврате, указанном в декларации по НДС за последующие налоговые периоды, и (или) представления налогового заявления о возврате превышения НДС за соответствующий налоговый период, по которому устранены нарушения. При этом должностным лицом налогового органа, ответственным за проведение тематической проверки по подтверждению достоверности сумм НДС, предъявленных к возврату, в обязательном порядке анализируются результаты аналитического отчета по таким поставщикам.»;
приложение 1 изложить в новой редакции согласно приложению 1 к настоящему приказу;
Инструкцию дополнить приложениями 5 и 6 согласно приложениям 2 и 3 к настоящему приказу.

Приложение 1
к приказу Министра финансов
Республики Казахстан
от 25 июля 2012 года № 350
Приложение 1
к Инструкции по применению
Системы управления рисками в
целях возврата превышения
налога на добавленную стоимость
Критерии Системы управления рисками, подлежащие использованию органами налоговой службы при рассмотрении требований (налоговых заявлений) о возврате превышения налога на добавленную стоимость
№ №
п.п.
На­име­но­ва­ние кри­те­рия
Ко­ли­че­ство
бал­лов
1.
Ко­эф­фи­ци­ент на­ло­го­вой на­груз­ки (да­лее - КНН) на­ло­го­пла­тель­щи­ка ни­же сред­не­от­рас­ле­во­го зна­че­ния КНН, сло­жив­ше­го­ся по рес­пуб­ли­ке за по­след­ний ка­лен­дар­ный год
10
2.
От­ра­же­ние на­ло­го­пла­тель­щи­ком убыт­ка на про­тя­же­нии трех по­сле­до­ва­тель­ных лет
10
3.
Пред­став­ле­ние за две­на­дца­ти­ме­сяч­ный пе­ри­од, пред­ше­ству­ю­щий да­те пред­став­ле­ния тре­бо­ва­ния (на­ло­го­во­го за­яв­ле­ния) о воз­вра­те пре­вы­ше­ния НДС, до­пол­ни­тель­ной от­чет­но­сти по НДС на умень­ше­ние бо­лее двух раз
10
4.
По­сто­ян­ное пре­вы­ше­ние за­че­та по НДС за по­след­ние 3 го­да
5
5.
На­ло­го­пла­тель­щик дли­тель­ное вре­мя (бо­лее трех лет) не под­вер­гал­ся ком­плекс­ной на­ло­го­вой про­вер­ке
5
6.
На­ли­чие вза­и­мо­рас­че­тов с вза­и­мо­свя­зан­ны­ми сто­ро­на­ми, опре­де­ля­е­мое в со­от­вет­ствии с за­ко­но­да­тель­ством Рес­пуб­ли­ки Ка­зах­стан, за по­след­ние 3 го­да
5
7.
Осу­ществ­ле­ние со­мни­тель­ных сде­лок (с лже­пред­при­я­ти­я­ми, на­ло­го­пла­тель­щи­ка­ми, не пред­став­ля­ю­щи­ми или пред­став­ля­ю­щи­ми ну­ле­вую на­ло­го­вую от­чет­ность, а та­к­же без­дей­ству­ю­щи­ми, сня­ты­ми с уче­та по НДС, лик­ви­ди­ро­ван­ны­ми и банк­ро­та­ми) за по­след­ние 5 лет
35
8.
Осу­ществ­ле­ние де­я­тель­но­сти в сфе­рах по­вы­шен­но­го рис­ка с ве­ро­ят­но­стью неис­пол­не­ния и (или) непол­но­го ис­пол­не­ния на­ло­го­во­го обя­за­тель­ства (стро­и­тель­ство, тор­гов­ля) со­глас­но ре­ги­стра­ци­он­ным дан­ным
10
9.
На­ли­чие в две­на­дца­ти­ме­сяч­ном пе­ри­о­де, пред­ше­ству­ю­щем да­те пред­став­ле­ния тре­бо­ва­ния (на­ло­го­во­го за­яв­ле­ния) о воз­вра­те пре­вы­ше­ния НДС, под­твер­жден­ных на­ру­ше­ний, вы­яв­лен­ных по ре­зуль­та­там ка­ме­раль­но­го кон­тро­ля
5
10.
Ре­а­ли­за­ция то­ва­ров, ра­бот, услуг по це­нам ни­же це­ны при­об­ре­те­ния (по име­ю­щей­ся ин­фор­ма­ции, в т.ч. по ре­зуль­та­там преды­ду­щих на­ло­го­вых про­ве­рок) за по­след­ние 5 лет
10
11.
На­ли­чие в две­на­дца­ти­ме­сяч­ном пе­ри­о­де, пред­ше­ству­ю­щем да­те пред­став­ле­ния тре­бо­ва­ния (на­ло­го­во­го за­яв­ле­ния) о воз­вра­те пре­вы­ше­ния НДС, вы­став­лен­но­го уве­дом­ле­ния № 10
5
12.
На­ли­чие в две­на­дца­ти­ме­сяч­ном пе­ри­о­де, пред­ше­ству­ю­щем да­те пред­став­ле­ния тре­бо­ва­ния (на­ло­го­во­го за­яв­ле­ния) о воз­вра­те пре­вы­ше­ния НДС, од­но­го или несколь­ких из сле­ду­ю­щих фак­тов: пред­став­ле­ние пер­во­на­чаль­ной де­кла­ра­ции по НДС, со­дер­жа­щей тре­бо­ва­ние о воз­вра­те пре­вы­ше­ния НДС; пе­ре­ре­ги­стра­ция на­ло­го­пла­тель­щи­ка; сме­на ме­ста на­хож­де­ния на­ло­го­пла­тель­щи­ка
10

Приложение 2
к приказу Министра финансов
Республики Казахстан
от 25 июля 2012 года № 350
Приложение 5
к Инструкции по применению
Системы управления рисками в
целях возврата превышения
налога на добавленную стоимость
Пример определения суммы превышения НДС, подлежащей возврату
Из предъявленной к возврату-суммы превышения НДС исключается наименьшая из сумм НДС, отнесенных в зачет поставщиками товаров, работ, услуг от налогоплательщика, по которому установлены нарушения налогового законодательства, до плательщика НДС, представившего требование (налоговое заявление) о возврате превышения НДС - 150 т.т.

Приложение 3
к приказу Министра финансов
Республики Казахстан
от 25 июля 2012 года № 350
Приложение 6
к Инструкции по применению
Системы управления рисками в
целях возврата превышения
налога на добавленную стоимость
Пример определения суммы превышения НДС, подлежащей возврату
Из предъявленной к возврату суммы превышения НДС исключается наименьшая из следующих сумм: суммы НДС, суммарно сложившейся из сумм НДС, определенных в соответствии с подпунктом 1) пункта 11 настоящей Инструкции, и суммы НДС, отнесенной в зачет плательщиком НДС, представившим требование (налоговое заявление) о возврате превышения НДС, от непосредственного поставщика - 1 000 т.т.